Dirección de Capacitación, estructura, implementa y coordina programas de actualización y especialización de servidores públicos en activo, formación inicial de personas agentes del Ministerio Público de la Federación y peritos profesionales.
Provee oferta de capacitación en los ámbitos de seguridad pública, impartición, procuración de justicia y ejecución de sanciones.
Desde el 11 de diciembre de 2017, el INACIPE se acreditó como Entidad de Certificación y Evaluación de Competencias (CONOCER) en distintos estándares de competencia.